Hít thở, phản xạ và các chức năng không tự chủ khác của cơ thể chủ yếu do thân não chi phối. Đây là vùng não nằm ở phía sau đầu kết nối não và cột sống. Thân não có một số cấu trúc con kiểm soát các chức năng khác nhau của cơ thể.
Ở người, thân não được chia thành tủy não, pons và não giữa. Thun tủy là phần thấp nhất của thân não, nằm bên cạnh đỉnh của cột sống. Nó kiểm soát hơi thở và các chức năng thiết yếu khác, chẳng hạn như huyết áp. Các phản xạ được kiểm soát bởi não giữa, gây ra hoạt động ở cùng khu vực có các thụ thể cảm giác đau.