Điện di gel tự nhiên là phương pháp mà các protein được tách ra trên gel mà không bị biến tính hoặc xử lý bằng hóa chất gọi là SDS hoặc natri dodecyl sulphat. Điện di trên gel tự nhiên khác với điện di trên gel biến tính ở rằng các protein được phân tích vẫn xếp lại và giữ nguyên điện tích của chúng.
Cả hai loại điện di trên gel đều hoạt động theo nguyên tắc cơ bản giống nhau. Các mẫu protein được nạp vào đầu gel polyacrylamide. Một dòng điện chạy qua gel, và các protein di chuyển qua gel. Trong gel biến tính, các protein được phủ bởi SDS, mang lại cho chúng điện tích âm mạnh. Do đó, các protein biến tính di chuyển qua gel chủ yếu dựa trên trọng lượng phân tử của chúng.
Trong điện di trên gel tự nhiên, các protein vẫn còn gấp khúc, do đó, hình dạng của protein ảnh hưởng đến tốc độ di chuyển qua gel. Các protein cũng giữ lại điện tích ban đầu của chúng, và do đó, các điện tích khác nhau sẽ ảnh hưởng đến cách protein chạy qua gel gốc.
Điện di gel tự nhiên được sử dụng để nghiên cứu liên kết với các hợp chất khác, sự tập hợp và cấu trúc. Gel tự nhiên là cần thiết cho nhiều kỹ thuật này, vì biến tính protein khiến nó mất cấu trúc và bất kỳ liên kết liên kết nào mà nó có thể có. Lợi ích cuối cùng của điện di gel tự nhiên là có thể chiết xuất các protein sau khi chạy gel.
