Khoảng một phần ba số loài cú trên thế giới có nguy cơ tuyệt chủng hoặc có nguy cơ tuyệt chủng. Các loài có nguy cơ tuyệt chủng bao gồm cú vịnh châu Phi, cú đào hang, cú vọ đuôi dài và cú vằn đốm.
Nguyên nhân chính khiến một số loài cú có nguy cơ tuyệt chủng thường là do mất môi trường sống. Ví dụ, cú đào hang sống ở đồng cỏ ở phía tây của Bắc Mỹ. Việc chuyển đổi đồng cỏ thành đất nông nghiệp đã phá hủy phần lớn môi trường sống của loài cú đào hang, khiến chúng không còn nơi nào để sống và không có đủ thức ăn để ăn. Những con cú đào hang giờ chỉ có thể sống ở những khu vực đồng cỏ nhỏ còn tồn tại để nhường đất ăn cỏ cho gia súc. Cú đào hang cũng không tự đào lỗ trên mặt đất để làm tổ mà thay vào đó chúng phải sử dụng các lỗ do chim săn mồi, chó đồng cỏ và các loài động vật đào hang khác. Những động vật này là động vật gây hại cho con người, đặc biệt là ở các khu vực nông nghiệp, vì vậy nhiều người đã giết chúng ngay lập tức. Do đó, số lượng chúng tồn tại ít hơn để cung cấp cho những con cú cái tổ mà chúng cần. Quá trình tương tự đang xảy ra với nhiều loài cú có nguy cơ tuyệt chủng khác vì ảnh hưởng của con người khiến tỷ lệ sinh sản thấp do thiếu chỗ làm tổ và tỷ lệ tử vong cao do vật nuôi của con người như mèo đang giết chúng. Kết quả là nhiều loài cú trở nên nguy cấp.
