Sắc tố trong thực vật được tạo ra và lưu trữ trong các bào quan được gọi là plastid. Plastid phổ biến nhất là lục lạp, là một bào quan màu xanh lục với chất diệp lục có sắc tố xanh lục. Chất diệp lục là sắc tố quan trọng nhất để quang hợp.
Sắc tố là những hợp chất đặc biệt phản chiếu một màu nhất định của ánh sáng. Đối với hầu hết các loại cây xanh, chất diệp lục, phản xạ ánh sáng xanh là phổ biến nhất. Tuy nhiên, thực vật có các sắc tố khác được sử dụng cho các mục đích khác ngoài quang hợp, chẳng hạn như ngoại hình. Ví dụ, nhiều hoa và quả của thực vật có tế bào sắc tố, có nhiều màu sắc khác nhau. Ớt chuông có các tế bào sắc tố, thay đổi theo thời gian để cho biết độ chín của quả.
