Không bào xâm nhập vào các vật liệu sản xuất năng lượng thông qua quá trình nội bào. Lysosome gắn vào các bào quan này, hợp nhất khi các enzym tiêu hóa nội dung của không bào. Lysosome và không bào phối hợp với nhau để tạo thành hệ tiêu hóa cho tế bào nhân thực.
Vật chất được sử dụng để sản xuất năng lượng - chẳng hạn như tinh bột, chất béo và glycogen - đi vào tế bào thông qua quá trình nội bào. Không bào hình thành bằng quá trình tách ra khỏi màng ngoài của tế bào. Khi không bào bao bọc vật chất, nó sẽ trở thành endosome. Được bao quanh bởi màng tế bào của chính nó, các ống nội soi lưu trữ các vật liệu tế bào cho đến khi chúng sẵn sàng để xử lý bởi các lysosome.
Trong khi cấu trúc được tạo ra bởi cơ thể Golgi, các enzym mạnh được tạo ra bởi lưới nội chất. Khoảng 50 enzym khác nhau, được gọi là axit hydrolase, phân hủy protein, vật liệu di truyền, polysaccharid, lipid và các bào quan trong một quá trình gọi là autophagy. Lysosome gắn vào endosome, tạo ra một lysosome khác nơi vật chất tiêu hóa. Bao quanh lysosome là một lớp màng tế bào để bảo vệ phần còn lại của tế bào khỏi các chất bên trong của chúng. Khi vật liệu đã được tiêu hóa đầy đủ, chúng sẽ khuếch tán qua màng lysosome vào tế bào chất.
Các tình trạng di truyền như bệnh Tay-Sachs có thể dẫn đến rối loạn chức năng của hệ thống thải bỏ này. Do thiếu enzym, việc tích tụ các đại phân tử không tiêu hóa được sẽ gây bất lợi cho hệ thần kinh và các cơ quan khác.
