Phản ứng giữa các nguyên tử của cùng một nguyên tố hoặc giữa các nguyên tử của các nguyên tố khác nhau dẫn đến sự hình thành các hợp chất. Các hợp chất được phân loại là phân tử hoặc ion dựa trên phương thức hình thành của chúng.
Khi các nguyên tử tạo thành ion bằng cách nhận hoặc bằng cách cho electron, chúng tạo thành các ion âm và dương. Các ion này đến gần nhau và hình thành liên kết ion dẫn đến hình thành các hợp chất ion.
Sự hình thành phân tử natri clorua là một ví dụ về hợp chất được hình thành bởi liên kết ion.
Số hiệu nguyên tử của natri là 11. Cấu hình electron của nó là 2, 8, 1, vì vậy nó có một electron ở lớp vỏ ngoài cùng. Số hiệu nguyên tử của clo là 17. Cấu hình electron của nó là 2, 8, 7, vì vậy nó cần một electron để hoàn thành lớp vỏ cuối cùng với tám electron để tạo cho nó sự ổn định. Nguyên tử clo nhận một điện tử từ nguyên tử natri, dẫn đến sự hình thành các ion Na + và Cl-. Ion natri tích điện dương và ion clorua tích điện âm tạo thành liên kết ion do lực hút tĩnh điện dẫn đến sự hình thành phân tử natri clorua.
Khi các nguyên tử phản ứng và chia sẻ các cặp electron, chúng hình thành liên kết cộng hóa trị do đó tạo ra các hợp chất cộng hóa trị hoặc phân tử. Phân tử oxy hình thành khi hai nguyên tử oxy chia sẻ hai cặp electron, tạo ra một liên kết cộng hóa trị đôi. Liên kết cộng hóa trị ba được hình thành giữa hai nguyên tử nitơ, tạo ra phân tử nitơ.