Các cấp độ tổ chức sinh thái là sinh quyển, quần xã sinh vật, hệ sinh thái, quần xã, quần thể và cá thể. Tổ chức sinh thái giúp con người hiểu được cấu trúc và chức năng của toàn bộ các nhóm vi sinh vật, thực vật và động vật riêng lẻ và như toàn bộ.
Trái đất là một sinh quyển. Nó bao gồm tất cả các sinh vật sống, cả thực vật và động vật, cũng như mọi quần xã sinh vật trên Trái đất. Quần xã sinh vật là những vùng cụ thể có chung hệ sinh thái. Có sa mạc, rừng, lãnh nguyên, đồng cỏ và quần xã sinh vật dưới nước trên Trái đất. Mỗi quần xã sinh vật chính này được chia thành các loại riêng biệt. Ví dụ, quần xã sinh vật rừng được chia thành rừng ôn đới, nhiệt đới và rừng núi.
Một hệ sinh thái bao gồm một cộng đồng sinh vật sống cụ thể, nhưng cũng bao gồm các yếu tố phi sinh học khác, chẳng hạn như đá, nước, không khí và nhiệt độ. Một quần xã bao gồm tất cả các sinh vật trong một khu vực tại một thời điểm nhất định. Các cộng đồng thường rất đa dạng về mặt sinh học.
Quần thể là một loài nhất định trong một khu vực tại một thời điểm nhất định. Quần thể bao gồm các cấu trúc di truyền khác nhau của cùng một loài. Ví dụ, dân số loài người bao gồm nhiều sắc tộc khác nhau. Cuối cùng, cá thể có thể được định nghĩa là bất kỳ loài hoặc sinh vật sống nào. Các cá thể không sinh sản với các cá thể từ các nhóm khác. Động vật rất rõ ràng liên quan đến việc lai tạo, trong khi một số loài thực vật có thể lai tạo với các loài thực vật khác.