Các phần không sống của hệ sinh thái được gọi là các thành phần phi sinh học hoặc các yếu tố phi sinh học. Chúng bao gồm các phần của hệ sinh thái không sống nhưng vẫn ảnh hưởng đến nó. Ví dụ như nước, đất, không khí, nhiệt độ và ánh sáng mặt trời.
Các yếu tố phi sinh học cũng quan trọng đối với hệ sinh thái như các thành phần sống. Các yếu tố phi sinh học ảnh hưởng đến các dạng sống có thể tồn tại trong một hệ sinh thái cụ thể. Ví dụ, nhiệt độ ở sa mạc so với nhiệt độ ở bắc cực ảnh hưởng đến kiểu sống được tìm thấy trong các hệ sinh thái đó.
Các sinh vật có khả năng thay đổi thành phần phi sinh học trong hệ sinh thái của chúng. Ví dụ, nấm men tạo ra rượu như một sản phẩm phụ phi sinh học của quá trình hô hấp, làm cho môi trường trở nên độc hại đối với một số sinh vật.
