Gan của con người nằm ở bên phải của cơ thể ở hầu hết mọi người, mặc dù có một số tình trạng bẩm sinh mà gan nằm ở bên trái. Cho dù gan ở bên phải hay bên trái, nó luôn nằm bên trong khoang bụng.
Gan nằm ở phần trên của bụng, bên dưới cơ hoành, nằm trên dạ dày, ruột non và một trong những quả thận. Những người mắc bệnh situs inversus hoặc heterotaxy có gan nằm ở bên trái. Situs inversus được coi là một tình trạng tương đối vô hại, vì tất cả các cơ quan đều được đảo ngược trong một hình ảnh phản chiếu hoàn hảo của cơ thể người điển hình. Heterotaxy làm đảo ngược vị trí của một số cơ quan chứ không phải các cơ quan khác và có thể dẫn đến vàng da do kết nối giữa các cơ quan không được hình thành chính xác.