Ví dụ về vi khuẩn tốt bao gồm L. acidophilus, Bifidobacterium bifidum, Streptococcus thermophilus và Bacillus coagulans, và một số ví dụ về vi khuẩn xấu bao gồm Clostridium perfringens, salmonella, staphyloccus aureus và listeria monocytogenes. Một số loại vi khuẩn có thể vừa tốt vừa xấu.
L. acidophilus là vi khuẩn tốt được sử dụng phổ biến nhất. Nó tồn tại trong ruột và hỗ trợ quá trình tiêu hóa bằng cách tạo ra hydrogen peroxide và axit lactic, ngăn vi khuẩn xấu phát triển. L. acidophilus được tìm thấy trong sữa chua probiotic.
Bifidobacterium bifidum là một loại vi khuẩn tốt có thể giúp chữa lành vết loét dạ dày do một loại vi khuẩn xấu gọi là Helicobacter pylori gây ra. Nó cũng có thể làm giảm hội chứng ruột kích thích, nhiễm trùng nấm men và bệnh chàm dị ứng. Streptococcus thermophilus là một vi khuẩn tốt có thể giúp làm giảm các triệu chứng liên quan đến không dung nạp lactose, chẳng hạn như buồn nôn, chuột rút và tiêu chảy. Bacillus coagulans là một loại vi khuẩn tốt có thể giúp giải quyết các vấn đề về đường tiêu hóa và ngăn ngừa nhiễm trùng đường hô hấp.
Các vi khuẩn xấu như salmonella, Clostridium perfringens, listeria monocytogenes và staphyloccus aureusis là nguyên nhân chính gây tử vong, nhập viện và ốm đau ở United STates. Escherichia coli là một loại vi khuẩn có thể tốt hoặc xấu. Nó cư trú trong ruột, nhưng một số sợi có thể gây ra các bệnh nghiêm trọng, nhiễm trùng đường tiết niệu và tiêu chảy.
