Tên được đặt cho liên kết giữa các phân tử nước là liên kết hydro. Các liên kết này xảy ra giữa oxy hơi âm của một phân tử nước và hydro hơi dương của phân tử nước khác. Liên kết hydro tạo cho nước những tính chất vật lý đặc biệt.
Sự khác biệt về độ âm điện giữa hydro và oxy dẫn đến sự chia sẻ không bình đẳng của các electron. Độ âm điện đo mức độ mạnh của một nguyên tử thu hút các electron. Ôxy, với độ âm điện lớn hơn, kéo các điện tử dùng chung nhiều hơn, tạo cho nguyên tử ôxy một phần điện tích âm thuần. Các electron được chia sẻ dành ít thời gian hơn với các nguyên tử hydro; do đó, các vùng hydro của nước có một phần điện tích dương.
