Chim cánh cụt hoàng đế không được liệt kê là có nguy cơ tuyệt chủng vào năm 2015, nhưng dự kiến sẽ sớm được đưa vào danh sách như vậy do nhiệt độ tăng cao ở Nam Cực. Nhiệt độ này loại bỏ băng biển mà chim cánh cụt hoàng đế sử dụng làm Telegraph đưa tin.
Ủy ban liên chính phủ về biến đổi khí hậu (được gọi là IPCC) báo cáo rằng người ta tin rằng khoảng 66% của tất cả các đàn chim cánh cụt hoàng đế sẽ thấy số lượng của chúng giảm một nửa vào năm 2100. Tuy nhiên, quá nhiều băng biển cũng có thể là một tác hại điều dành cho chim cánh cụt. Nếu có quá nhiều băng biển thì chim cánh cụt phải rời khỏi đàn con trong một khoảng thời gian dài hơn để xuống biển và săn tìm thức ăn.
