Có nhiều khác biệt đáng kể giữa sự sao chép DNA của sinh vật nhân sơ và sinh vật nhân chuẩn. Một trong những điểm khác biệt đó là sự phức tạp của quá trình sao chép của tế bào nhân thực so với sự đơn giản tương đối của quá trình sao chép trong tế bào nhân sơ. Một sự khác biệt lớn nữa là tốc độ sao chép diễn ra.
Vì tế bào nhân sơ có cấu trúc đơn giản hơn tế bào nhân thực nên quá trình nhân đôi ADN của tế bào nhân sơ đơn giản hơn nhiều. Đối với một, tế bào nhân sơ không có nhân là nơi vật chất di truyền được tìm thấy. Sự sao chép xảy ra trong tế bào chất của tế bào nhân sơ trái ngược với sự sao chép xảy ra trong nhân của tế bào nhân thực.
Nguồn gốc của sự sao chép trong tế bào nhân sơ chỉ giới hạn ở một nơi, trong khi có hơn 1.000 nguồn gốc ở tế bào nhân thực. Trong tế bào nhân sơ, sự sao chép xảy ra tại một thời điểm, trong khi sự sao chép của tế bào nhân thực xảy ra đồng thời tại tất cả các điểm gốc này. Cùng với đó, tế bào nhân sơ chỉ có một ngã ba sao chép trong khi tế bào nhân thực có nhiều ngã ba sao chép. Nhiễm sắc thể của tế bào nhân sơ không có chất nhiễm sắc, điều này tạo nên phần lớn nhiễm sắc thể trong tế bào nhân thực.
Cuối cùng, sự sao chép của sinh vật nhân sơ diễn ra nhanh chóng trong khi sự nhân lên của sinh vật nhân thực lại chậm. Tốc độ tái tạo tế bào nhân sơ này được chứng kiến cùng với sự phát triển nhanh chóng của vi khuẩn.
