Quá trình thụ tinh ở hoa diễn ra trong buồng trứng. Phấn hoa đậu trên phần cái của hoa, sau đó nó phát triển thành ống phấn và đào xuống bầu nhụy, nơi nó thụ tinh để cuối cùng trở thành hạt và quả của cây.
Phần đực của hoa được gọi là nhị hoa, và đó là cái mang phấn hoa. Phấn hoa có thể được truyền qua gió, động vật hoặc côn trùng, và hầu hết các loài thực vật phát triển sự thích nghi khuyến khích động vật địa phương đến và chuyển phấn hoa của chúng. Bộ phận hoa cái có ba phần: đầu nhụy, kiểu và bầu nhụy. Đầu nhụy có khả năng dính, giúp hạt phấn ở nguyên vị trí cho đến khi ống phấn đủ cứng để giữ cố định. Ống phấn đào xuống theo kiểu cho đến khi nó đến bầu nhụy, nơi chứa các noãn.
Tinh trùng được phóng thích vào buồng trứng, nơi chúng cạnh tranh để thụ tinh với noãn. Hầu hết các loài thực vật có hoa chứa cả hai bộ phận đực và cái và không có khả năng tự thụ phấn, mặc dù có những ngoại lệ cho cả hai quy tắc. Thụ phấn chéo, hoặc hoa được thụ phấn bởi các hoa khác, tạo ra con cái có khả năng phục hồi tốt hơn. Do đó, các bao phấn được định vị để làm cho quá trình tự thụ phấn khó thực hiện ở những cây có hoa có thể tự thụ phấn.