Ruồi giấm là một trong những thành viên nhỏ nhất của Bộ Diptera và có mắt kép lớn, rõ rệt, cơ thể hình bầu dục và một bộ bốn cánh, giống như ruồi lớn hơn. Ruồi giấm trung bình xấp xỉ 1 chiều dài milimet, và con cái lớn hơn con đực một chút. Chúng gần giống với nhiều loài ruồi về ngoại hình, có cùng hình dạng cơ thể độc đáo, đôi cánh lớn và đôi mắt lồi, nhưng có một số điểm khác biệt chính về mặt sinh học.
Ruồi giấm được tách biệt về mặt sinh học với họ hàng gần nhất của chúng bằng pectinate Aristae, là những cấu trúc giống như sợi lông nhỏ bao phủ râu của chúng. Ruồi giấm đập cánh nhanh và hung hãn hơn khi bay so với những người anh em họ lớn hơn của chúng, điều này mang lại cho chúng âm thanh vo ve đặc biệt và cao hơn khi bay trong không khí so với hầu hết các loài ruồi khác. Giống như những loài khác trong Order Diptera, ruồi giấm có màu sắc khác nhau tùy thuộc vào loài. Một số con có màu sắc rực rỡ và sống động, có thân và cánh màu cam sáng, đỏ thẫm và vàng, trong khi những con khác có màu xanh đậm, xám và đen. Ruồi giấm có râu dài, có thể to gấp đôi chiều dài cơ thể. Những chiếc râu này được trang bị các thiết bị cảm ứng cực nhỏ ở cuối để dẫn đường cho ruồi đến nguồn cung cấp thức ăn của chúng. Ruồi giấm có đôi mắt kép quá khổ, giống như hầu hết các loài côn trùng, về cơ bản giúp chúng có tầm nhìn 3 chiều