Mặc dù năng lượng mặt trời có nhiều tính năng tích cực, nhưng cũng có những nhược điểm bao gồm chất thải độc hại được thải ra do các tấm pin mặt trời bị hư hỏng hoặc xử lý tấm pin không đúng cách. Những nhược điểm khác bao gồm lượng đất cần thiết cho năng lượng mặt trời các ngân hàng bảng điều khiển đủ lớn để sản xuất điện thương mại, cũng như tính thẩm mỹ tiêu cực được nhận thấy.
Các tấm pin mặt trời chuyển đổi quang năng thành điện năng. Họ sử dụng các hóa chất khác nhau mà thông thường không gây ra vấn đề do quá trình nhà sản xuất sử dụng để niêm phong chúng để ngăn ngừa rò rỉ. Tuy nhiên, hư hỏng trong quá trình sử dụng có khả năng phát tán muối nóng chảy, dầu và các chất thải nguy hại khác ra môi trường. Tương tự, khi các tấm không còn sử dụng được, việc xử lý không đúng cách sẽ thải những hóa chất này ra môi trường.
Bản chất của các tấm pin mặt trời yêu cầu chúng phải khá lớn để tạo ra một lượng năng lượng đáng kể. Việc lắp đặt các ngân hàng tấm pin mặt trời để sản xuất điện ở mức độ thương mại thường bao gồm việc chặt cây cối và các thảm thực vật khác để tạo ra một trường năng lượng mặt trời không bị cản trở. Việc loại bỏ thảm thực vật tác động trực tiếp đến hệ sinh thái và môi trường sống tại địa phương, làm tăng thêm nhận thức tiêu cực về các tấm pin mặt trời.
Ngoài ra, các tấm pin mặt trời thường có kiểu dáng công nghiệp mà một số người cảm thấy không hài lòng khi được lắp đặt trên các ngôi nhà hoặc công trình thương mại. Đặc biệt là ở những khu vực có phong cảnh đẹp, chẳng hạn như sa mạc, những tác phẩm sắp đặt này không hấp dẫn về mặt thị giác đối với những người thích một cái nhìn không bị xáo trộn về vẻ đẹp tự nhiên của khu vực.