Một nhược điểm lớn của việc chôn rác trong các bãi chôn lấp là có thể gây ô nhiễm đất và nước ngầm xung quanh với các chất độc và nước rỉ rác. Khi rác phân hủy, nó giải phóng mêtan và các khí nhà kính khác góp phần làm thay đổi khí hậu và có thể cũng gây ra các vấn đề sức khỏe cho con người và động vật.
Thùng rác thường chứa một lượng lớn hóa chất độc hại, chẳng hạn như thủy ngân, thạch tín, chì và PVC. Những chất độc này tích tụ trong bãi rác theo thời gian và có khả năng gây ô nhiễm và gây thiệt hại nghiêm trọng cho khu vực xung quanh nếu chúng không được ngăn chặn. Một nguồn ô nhiễm chính tiềm tàng khác là nước rỉ rác, là chất lỏng có độc tính cao hình thành khi thùng rác phân hủy.
Khí bãi rác, đề cập đến một lượng lớn carbon dioxide, mêtan và các khí nhà kính độc hại khác được tạo ra trong quá trình phân hủy, là một vấn đề khác. Ngoài việc gây hại cho môi trường, khí mê-tan cực kỳ dễ cháy và đã có trường hợp chất này ngấm vào các tòa nhà gần bãi rác và dẫn đến nổ.
Tất cả những vấn đề này trở nên tồi tệ hơn bởi thực tế là phải mất hàng trăm đến hàng nghìn năm để hầu hết các thùng rác trong các bãi chôn lấp phân hủy. Điều này có nghĩa là tất cả những vấn đề này có thể tiếp diễn và thậm chí trở nên tồi tệ hơn theo thời gian.