Một ví dụ về giao phối cận huyết trong tự nhiên là một nhóm 40 người cộng tính biệt lập ở Thụy Điển. Bởi vì chúng không thể tiếp cận với những con khác cùng loài của mình, con cái của những con rắn đã lai tạp nhiều lần. Ngựa cái vô địch cuộc đua Coronation V là một ví dụ về giao phối cận huyết là kết quả của quá trình chọn lọc nhân tạo của một nhà lai tạo.
Giao phối cận huyết đề cập đến sự giao phối của những người họ hàng gần. Nó xảy ra trong tự nhiên khi các quần thể nhỏ của một loài bị tách ra khỏi đồng loại của chúng, như khi các hoạt động canh tác bị cô lập với những người Thụy Điển. Một ví dụ khác là những con sói xám ở Isle Royale, Michigan, chúng đã không thể giao phối với những con sói từ Canada do không có cầu băng giữa những quần thể này trong vài năm. Trong cả hai trường hợp, giao phối cận huyết đã làm tăng số lượng động vật bị dị tật và giảm khả năng sinh sản thành công. Vì những động vật có quan hệ họ hàng gần có nhiều khả năng có chung các gen lặn gây chết người hoặc bất lợi nên việc giao phối với những động vật này sẽ làm tăng nguy cơ con cái thừa hưởng gen lặn có hại từ cả bố và mẹ.
Bất chấp rủi ro giao phối cận huyết, các nhà lai tạo con người đôi khi giao phối các động vật có liên quan để tạo ra một loại phù hợp thể hiện các đặc điểm mong muốn. Trong trường hợp Đăng quang V, cha mẹ cô, con trai và con gái của nhà vô địch Pháp Tourbillon, đều là những con ngựa đua xuất sắc. Coronation V là con ngựa cái Pháp tốt nhất trong thời đại của cô ấy, nhưng hoàn toàn cằn cỗi với tư cách là một con ngựa giống.