Loại liên kết giữ các bazơ nitơ với nhau được gọi là liên kết hydro. Bazơ nitơ xuất hiện trong các nucleotit, là những khối xây dựng hóa học cơ bản tạo nên cấu trúc hóa học của DNA.
Có hai loại bazơ chứa nitơ (hợp chất vòng) được tìm thấy trong DNA. Chúng là purin và pyrimidine. Purine có vòng đôi và bao gồm guanin (G) và adenin (A). Pyrimidine là cấu trúc vòng đơn và bao gồm cytosine (C) và thymine (T). Các bazơ tạo thành cặp bằng cách liên kết với một bazơ bổ sung, khác (cặp purin với pyrimidine, G với C và A với T). Liên kết hình thành giữa hai bazơ được gọi là liên kết hydro, là một liên kết yếu xảy ra trong khoảng cách ngắn và có thể dễ dàng bị phá vỡ hoặc hình thành.
