Hai axit amin trong protein được liên kết với nhau bằng liên kết peptit hoặc liên kết amit. Các axit amin được liên kết bởi nhóm alpha-cacboxyl của một loại với nhóm alpha-amino của bên kia . Protein được cấu tạo bởi một chuỗi liên kết peptit liên kết với nhau để tạo thành chuỗi polypeptit mạch thẳng.
Khi hai axit amin liên kết với nhau bằng liên kết peptit, phản ứng làm mất một phân tử nước. Chuỗi polypeptit là phân cực vì có các đầu khác nhau, với một nhóm alpha-cacboxyl ở một đầu và một nhóm alpha-amino ở đầu kia. Protein bao gồm một chuỗi polypeptit có từ 50 đến 2.000 axit amin, được nối với nhau bằng các liên kết peptit.
