Theo nghĩa chặt chẽ nhất, xung đột giữa con người và siêu nhiên có thể được mô tả là xung đột giữa con người và bất cứ thứ gì không thuộc tự nhiên. Siêu tự nhiên được định nghĩa "là thứ nằm ngoài tự nhiên hoặc có thể giải thích được bằng luật tự nhiên." Cuốn tiểu thuyết "Dracula" của Bram Stoker là một ví dụ điển hình về xung đột giữa con người với siêu nhiên vì Dracula là một nhân vật bất chấp thiên nhiên.
Tuy nhiên, điều quan trọng là không được nhầm lẫn siêu nhiên với điều huyền bí. Điều huyền bí đặc biệt áp dụng cho những điều hoặc sự kiện xảy ra bên ngoài tự nhiên mà thách thức tất cả các giải thích khoa học. Paranormal là một lĩnh vực bên trong siêu nhiên. Siêu năng lực là một ví dụ về những thứ siêu nhiên, nhưng có thể là huyền bí hoặc không. Khả năng quay mạng của Người nhện không phải tự nhiên mà có, nhưng về mặt khoa học thì có thể giải thích được. Peter Parker đã bị cắn bởi một con nhện phóng xạ. Về vấn đề này, cũng cần hiểu rằng "có thể giải thích một cách khoa học" có thể có liên quan trong một thế giới đã được thiết lập trong tiểu thuyết. Con người so với siêu nhiên cũng có thể vượt qua những xung đột cốt truyện chính khác. Theo cách này, đôi khi nó hoạt động như một xung đột phụ. Chẳng hạn, một cốt truyện liên quan đến cuộc xung đột giữa con người với Chúa cũng có thể được phân loại là con người với cuộc xung đột siêu nhiên bởi vì Chúa không có bản chất tự nhiên. Tuy nhiên, hai xung đột cốt truyện không đồng nghĩa với nhau, bởi vì tất cả những điều siêu nhiên không được tìm thấy trong Chúa.