Hợp chất halogen là sự kết hợp của một hoặc nhiều nguyên tố hóa học bao gồm một halogen; halogen là một nhóm các nguyên tố bao gồm flo, astatine, clo, brom và iot. Các halogen bao gồm cột thứ bảy của bảng tuần hoàn các nguyên tố.
Cả hợp chất tổng hợp và hợp chất hữu cơ bao gồm halogen đều được coi là hợp chất halogen; điều này bao gồm các hợp chất như cacbon tetraclorua, vinyl clorua và metylen clorua. Một số hợp chất halogen hóa này, đặc biệt là những hợp chất được coi là hợp chất hữu cơ dễ bay hơi được halogen hóa, rất nguy hiểm và có thể rất độc, gây ung thư hoặc gây đột biến cho người và động vật khác. Ví dụ, có một số loại thuốc trừ sâu, bao gồm cả thuốc trừ sâu hóa học nổi tiếng nguy hiểm, DDT, là các hợp chất halogen hóa.
Mặc dù DDT đã được sử dụng để kiểm soát bệnh tật, bao gồm cả sốt rét và sốt phát ban, nhưng nó cũng có hại cho các hệ sinh thái tự nhiên. Hợp chất halogen hóa này, bao gồm clo halogen, đã được rải khắp Hoa Kỳ vào giữa những năm 1900. Trong chuyên luận bảo vệ môi trường nổi tiếng của mình "Silent Spring", Rachel Carson đã viết về tác động môi trường nguy hiểm của hóa chất độc hại này, bao gồm cả việc nó dễ dàng hấp thụ vào đất và tác động của nó đối với động vật như chim. DDT làm cho vỏ trứng mỏng đi, gây nguy hiểm cho phôi gia cầm. Đây là một yếu tố chính góp phần vào nguy cơ tuyệt chủng của đại bàng hói.