Hệ thống tiêu hóa và nội tiết hoạt động cùng nhau, chủ yếu thông qua tuyến tụy, để sản xuất và phân phối các enzym tiêu hóa. Hệ thống nội tiết chứa một số cơ quan và tuyến khác nhau, đó là vùng dưới đồi, tuyến yên, tuyến cận giáp, tuyến thượng thận các tuyến, tuyến sinh sản, tuyến giáp và thể tùng. Vai trò chính của hệ thống nội tiết là sản xuất các hormone quan trọng cho hệ tiêu hóa biết khi nào nên bắt đầu tiêu hóa thức ăn và khi nào thì dừng lại.
Hầu hết các tuyến trong hệ thống nội tiết là nhà sản xuất hormone chính trong cơ thể, mặc dù một số cơ quan khác, chẳng hạn như tim, phổi, não, thận, gan, tuyến ức và da, cũng sản xuất hormone, sau đó được tiết ra khắp cơ thể. Ngoài việc gửi tín hiệu thông qua tuyến tụy để cho hệ tiêu hóa biết khi nào bắt đầu hoạt động, hệ thống nội tiết giúp kiểm soát và ổn định tâm trạng, phát triển và tăng trưởng theo thời gian. Hệ thống nội tiết cũng hỗ trợ chức năng mô thích hợp và đóng một vai trò lớn trong việc kiểm soát chức năng tình dục và sinh sản. Hệ thống nội tiết điều chỉnh quá trình trao đổi chất, diễn ra ở các tỷ lệ khác nhau trong dân số. Ngoài việc chia sẻ trách nhiệm với hệ tiêu hóa, hệ thống nội tiết còn hợp tác với hệ thần kinh để kiểm soát các chức năng sống, chẳng hạn như thở và vận động.