Hệ thống miễn dịch hoạt động với cả hệ thống bạch huyết và hệ tuần hoàn. Cả hai hệ thống này đều giúp vận chuyển mầm bệnh đến các cơ quan miễn dịch để hệ thống miễn dịch có thể tiêu diệt chúng. Hệ thống miễn dịch cũng hoạt động với hệ thống liên kết.
Hệ thống bổ sung bao gồm tất cả các tế bào da trong cơ thể. Hệ thống miễn dịch làm việc với da để giúp giữ các mầm bệnh lạ ra khỏi cơ thể. Da thường là tuyến phòng thủ đầu tiên đối với các tác nhân gây bệnh từ bên ngoài. Nó hoạt động như một rào cản bên trong cơ thể và ngăn chặn mầm bệnh xâm nhập vào cơ thể.
Hệ thống miễn dịch hoạt động với hệ thống tuần hoàn và bạch huyết để vận chuyển. Các kháng nguyên và mầm bệnh xâm nhập vào cơ thể phải được vận chuyển đến các hạch bạch huyết hoặc lá lách để xử lý và diệt trừ. Khi chúng đến lá lách hoặc các hạch bạch huyết, các kháng nguyên sẽ xuất hiện trong các tế bào bạch huyết và được gắn thẻ để tiêu diệt.
Các tế bào miễn dịch như thực bào và bạch cầu trung tính nhấn chìm các mầm bệnh và tiêu diệt chúng. Những tế bào miễn dịch này và những tế bào khác sống trong các cơ quan và mô bạch huyết như lá lách và các hạch bạch huyết. Chúng lưu thông trong cơ thể bằng cách sử dụng hệ thống tuần hoàn. Các tế bào miễn dịch tuần hoàn tìm thấy các kháng nguyên chưa đến được các cơ quan bạch huyết.