Hầu hết ATP cho quá trình hô hấp hiếu khí được tạo ra trong Chu trình Krebs, còn được gọi là chu trình axit xitric, phá vỡ pyruvate, sản phẩm cuối cùng của quá trình đường phân, để tạo ra ATP. Quá trình này được nhân đôi hai lần để nó có thể tạo ra gấp đôi số ATP so với các chu kỳ trước đó.
Quá trình đường phân tạo ra từ sáu đến tám ATP trong chu kỳ đầu tiên, chu kỳ này cũng tạo ra pyruvate, được chuyển thành Acetyl COA. Những COA này được xử lý để tạo ra sáu ATP khác trước khi phần còn lại của COA được xử lý trong chu trình axit xitric. Chu trình tạo ra sáu NADH, hai FADH2 và hai ATP. NADH tự sản xuất 18 ATP, sau đó FADH2 tạo ra 4 ATP khác để đi cùng với 2 ATP khác được tạo ra trong chu trình này.
