Nam giới có cơ quan sinh dục ngoài (dương vật, bìu và tinh hoàn) để sản xuất và phân phối tinh trùng, còn nữ giới có cơ quan sinh dục bên trong (âm đạo, tử cung và buồng trứng) để sản xuất trứng và phát triển phôi thai người. Hầu hết sự khác biệt về sinh lý giữa nam và nữ xảy ra do sự khác biệt trong hệ thống nội tiết trong các giai đoạn phát triển quan trọng, chẳng hạn như sự phát triển của bào thai và tuổi dậy thì.
Các chức năng của hệ thống nội tiết ở nam giới và phụ nữ dẫn đến những khác biệt sinh lý khác trong suốt cuộc đời. Ví dụ, nam giới tạo ra một loại nang lông rõ ràng và rõ ràng hơn được gọi là lông tận cùng trên ngực, bụng, mặt và lưng. Tuy nhiên, phụ nữ tạo ra một nang lông mịn hơn được gọi là lông vellus ở ít vùng trên cơ thể hơn. Việc sản xuất hormone trong hệ thống nội tiết cũng chịu trách nhiệm một phần cho sự phát triển và sự khác biệt của kiểu hói đầu ở nam giới và phụ nữ.Sự khác biệt lớn cũng có trong hệ thống xương và cơ ở nam giới và phụ nữ. Thông thường, nam giới sở hữu gân, dây chằng và xương dày hơn, khỏe hơn phụ nữ và nam giới nói chung có nhiều cơ hơn. Điều này dẫn đến sự khác biệt về sức mạnh thể chất và quá trình trao đổi chất của việc tiêu thụ và tích trữ calo. Trong khi đó, phụ nữ thường sở hữu hệ thống xương kém chắc chắn và cấu trúc trơn tru hơn so với nam giới.