Hàn Quốc là quê hương của nhiều loại động vật có vú và chim bản địa. Một số loài trong số này, chẳng hạn như loài chim mòng két đang bị đe dọa tuyệt chủng, sống chủ yếu trong quần xã sinh vật địa phương, trong khi những loài khác, chẳng hạn như cá voi, chỉ thăm các vùng biển gần Hàn Quốc theo mùa.
Cá voi là một số du khách ngoạn mục nhất của Hàn Quốc. Các loài cá voi có thể được tìm thấy trong vòng vài dặm từ bờ biển là cá voi lưng gù, cá nhà táng và cá voi xám. Trong nội địa, Hàn Quốc có cá sống ở sông và hồ, một số loài sống ở nơi nào khác trên Trái đất. Trong số này phải kể đến cá đắng Somjiny, đầu bò gốc Hàn Quốc, một số loài chạch và cá chạch đen.
Hàn Quốc có bốn loài kỳ nhông bản địa, đặc biệt là kỳ giông đường nứt Hàn Quốc. Loài này khác thường khi là loài kỳ giông không phổi duy nhất được biết đến là loài đặc hữu của châu Á. Những con trưởng thành thở trực tiếp qua da chứ không phải phổi như kỳ nhông móng vuốt Hàn Quốc.
Chuột đồng sọc phổ biến ở Đông Á, nhưng Hàn Quốc có một biến thể riêng của nó, chuột đồng sọc Jeju, mà một số nhà tự nhiên học cho rằng nên được phân loại thành loài riêng. Hàn Quốc cũng có một số động vật không xương sống bản địa bao gồm katydid (Sphagniana monticola), bướm đêm (Pyrausta nigrimaculata) và bọ cánh cứng (Demonax seoulensis).
