Sinh vật phân hủy là sinh vật ăn sinh vật chết và các chất thải của các sinh vật khác. Sinh vật phân hủy giúp chất dinh dưỡng quay trở lại hệ sinh thái. Một số ví dụ về sinh vật phân hủy là côn trùng, giun đất và vi khuẩn.
Bốn loại chất phân hủy là vi sinh vật, chẳng hạn như vi khuẩn và nấm; vi sinh vật, chẳng hạn như động vật nguyên sinh; mesofauna, chẳng hạn như bọ cánh cứng; và macrofauna, chẳng hạn như giun đất. Các chất phân hủy làm cho đất giàu hơn bằng cách thêm các hợp chất hữu cơ vào đó. Các chất như carbon, nước và nitơ được trả lại cho hệ sinh thái thông qua hoạt động của các sinh vật phân hủy. Những sinh vật thiết yếu này tiêu thụ chất hữu cơ, biến đổi các chất trở lại dạng vô cơ của chúng. Một số chất vô cơ được tạo ra bởi các chất phân hủy và trả lại môi trường bao gồm phốt phát, carbon dioxide và amoni.