Các nguyên tử của kẽm đều có 30 proton trong hạt nhân của chúng. Số proton của một nguyên tố bằng số nguyên tử của nó, được liệt kê ở góc trên bên trái của hộp nguyên tố trong tuần hoàn bảng các nguyên tố.
Nguyên tử luôn mang cùng số electron với số proton. Theo định nghĩa, một nguyên tử phải có tổng điện tích trung hòa, và điện tích âm của mỗi electron loại bỏ điện tích dương của một proton. Do đó, kẽm có 30 electron cũng như 30 proton. Số lượng neutron trong một nguyên tử có thể khác nhau, và một số cấu hình ổn định hơn những cấu hình khác. Các nguyên tử của một nguyên tố có số nơtron khác nhau được gọi là đồng vị của nguyên tố đó.
