Chuột sa mạc bao gồm chuột gỗ hoặc chuột đóng gói và chuột kangaroo. Chuột gỗ ăn xương rồng, vỏ yucca, hạt cỏ, vỏ cây, quả mọng, hạt pinon và thảm thực vật xanh. Chuột kangaroo ăn hạt cỏ và đậu mesquite và đôi khi sẽ ăn côn trùng hoặc thảm thực vật xanh.
Chuột kangaroo thích nghi với điều kiện khô hạn tốt hơn chuột gỗ và có thể sống mà không cần uống nước. Chuột gỗ phụ thuộc vào cây mọng nước để lấy nước và có thể đi giữa các gai xương rồng để kiếm thức ăn cho cây. Cả hai loại chuột đều quan trọng đối với chuỗi thức ăn của sa mạc. Chúng bị ăn thịt bởi cú, rắn, sói đồng cỏ, cáo, linh miêu và mèo đuôi nhẫn.
