Chức năng của cisternae đầu cuối là hoạt động như một nơi lưu trữ canxi. Trong quá trình co cơ, canxi được lưu trữ trong cisternae đầu cuối cần thiết cho chức năng thích hợp. Vị trí dự trữ canxi được sử dụng để co cơ này không giống với vị trí được sử dụng cho mô xương.
Trong cơ xương, hai cisternae tận cùng hợp nhất với một ống T để tạo thành cấu trúc bộ ba. Khi một cơ được kích thích, canxi sẽ được giải phóng từ bộ phận lưu trữ của cisternae đầu cuối. Canxi này liên kết với troponin-C trong chất lỏng để thực hiện quá trình co cơ.
Vai trò của canxi như một chất kích hoạt co cơ đã được phát hiện trong các thí nghiệm ở thế kỷ 20 trên mô ếch.