Có bốn phương thức dinh dưỡng cho vương quốc Eubacteria: quang tự dưỡng, hóa dưỡng, sinh dưỡng quang và sinh vật dị dưỡng. Mỗi phương thức này có một cách kết hợp khác nhau để chúng thu được năng lượng và carbon.
Sinh vật quang dưỡng là những sinh vật tiến hành quang hợp tương tự như thực vật, sử dụng ánh sáng để tạo ra năng lượng và carbon dioxide để tạo ra các hợp chất carbon. Chemoautotrophs cũng sử dụng carbon dioxide để tạo ra các hợp chất carbon, nhưng chúng sử dụng các hóa chất vô cơ làm nguồn năng lượng hơn là ánh sáng. Các sinh vật quang dưỡng lấy năng lượng từ ánh sáng mặt trời, nhưng cũng ăn các hợp chất cacbon hữu cơ như một nguồn cacbon. Chemoheterotrophs thu được cả năng lượng và carbon của chúng bằng cách ăn các hóa chất hữu cơ. Trong mọi trường hợp, khi tạo ra năng lượng bằng cách chuyển hóa chất, nguồn năng lượng có thể được gọi là chất cho điện tử và quá trình xử lý chất cho này thường yêu cầu chất nhận điện tử, phổ biến nhất là ôxy.
Vi khuẩn dựa vào việc ăn hóa chất để tạo năng lượng có thể phụ thuộc vào oxy hoặc có thể sử dụng các chất nhận điện tử khác. Vi khuẩn tạo ra năng lượng từ các hợp chất hóa học không có oxy hoặc sử dụng quá trình hô hấp kỵ khí hoặc lên men. Hô hấp kỵ khí đòi hỏi sử dụng các chất nhận điện tử thay thế như nitrat, sulfat hoặc carbon dioxide. Vi khuẩn sử dụng các hợp chất vô cơ để sản xuất năng lượng cũng có thể thường sử dụng hydro, carbon monoxide, amoniac hoặc các kim loại khử. Quá trình lên men không sử dụng bất kỳ chất nhận điện tử thay thế nào, thay vào đó tạo ra các chất thải như etanol hoặc axit lactic.
