Bộ phận sạch nhất trên cơ thể con người thường được coi là mắt vì khả năng tự làm sạch của nó. Mí mắt mở và tắt nhiều lần mỗi phút để giữ cho mắt sạch và ẩm. .
Mắt cũng tự bảo vệ thông qua việc sản xuất nước mắt. Nước mắt được tiết ra từ tuyến lệ trên mỗi mắt và giúp rửa sạch bụi bẩn, vi trùng hoặc các phần tử lạ khác, chẳng hạn như bụi. Tuyến lệ có thể được tìm thấy ở phía trên góc ngoài của mỗi mắt.
Mí mắt cũng có khả năng kiểm soát phản xạ tốt nên chúng có thể giúp ngăn ngừa tổn thương cho mắt. Một ví dụ về khả năng kiểm soát phản xạ của mắt là khi mí mắt tự động đóng lại bất cứ khi nào mắt tiếp xúc với ánh sáng chói từ ánh sáng mờ hoặc khi một vật thể đến gần mắt. Lông mi cũng giúp giữ cho đôi mắt sạch sẽ bằng cách giữ sạch bụi bẩn.
Con mắt có nhiều bộ phận giúp phát hiện ánh sáng cho phép con người nhìn thấy. Lớp mô nhạy cảm xung quanh bề mặt bên trong của mắt được gọi là võng mạc. Có các tế bào hình nón trong võng mạc giúp phát hiện màu sắc và các tế bào hình que giúp phát hiện sự tương phản ánh sáng yếu. Phần mở trung tâm của mắt xung quanh đồng tử là mống mắt và nó kiểm soát kích thước của đồng tử. Mống mắt cũng là phần có màu của mắt và là nơi một người sẽ có mắt màu nâu, xanh lam, xanh lục hoặc màu hạt dẻ.