Bộ não của con người có một số phần và mỗi phần có một màu sắc riêng biệt. Bề mặt của vỏ não thường được gọi là chất xám để phân biệt với các dây thần kinh có vỏ myelin bên dưới. một màu trắng sáng hơn nhiều.
Các hạch cơ bản của tế bào thần kinh chứa một sắc tố đặc biệt, được gọi là neuromelanin, làm chúng bị ố đen. Những khu vực này được gọi là substantia nigra, hay "vật chất đen", trong tiếng Latinh. Bộ não cũng có nhiều mạch máu với mạng lưới mạch máu phức tạp nuôi dưỡng mọi bộ phận của nó. Máu trong các mạch này truyền màu đỏ hoặc hồng đến hầu hết các mô của não sống.
