Cáo Fennec là con mồi cho chó rừng và đại bàng lớn, chẳng hạn như cú đại bàng. Mặc dù nó vẫn chưa được chứng minh, nhưng các loài động vật khác được cho là ăn cáo fennec bao gồm linh cẩu, caracals và chó nhà địa phương.
Các nhà khoa học biết rất ít về cuộc sống và hệ sinh thái của cáo fennec, vì vậy tổng số kẻ săn mồi ăn thịt cáo vẫn chưa được biết. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng cáo fennec rất nhanh nhẹn và nhanh nhẹn, điều này khiến chúng trở thành con mồi khó bắt. Tập tính sống về đêm và khả năng thích nghi sinh lý của cáo với môi trường sống khắc nghiệt ở sa mạc, chẳng hạn như tai lớn, bộ lông màu cát và khả năng sống sót mà không cần nước trong thời gian dài, càng làm tăng cơ hội sống sót của cáo.