Nhiệt độ, mức độ pH và nồng độ của enzym và cơ chất đều ảnh hưởng đến chức năng của enzym. Các chất ức chế hóa học cũng có thể ảnh hưởng đến cách thức hoạt động của enzym và làm giảm hiệu quả của chúng.
Nhiệt độ ảnh hưởng đến động năng của bất kỳ phân tử nhất định nào. Nhiệt độ ấm hơn cung cấp nhiều động năng hơn, tăng cơ hội cho các vụ va chạm phân tử thành công. Trên nhiệt độ tối ưu, cấu trúc enzym bắt đầu bị phá vỡ do các liên kết phân tử bị phá vỡ và điện thế hoạt động của xúc tác bị giảm.
Giống như nhiệt độ, cũng có một mức pH tối ưu cho chức năng của enzym. Sự thay đổi nồng độ pH có thể tạo ra hoặc phá vỡ các liên kết phân tử, thay đổi hình dạng của các enzym và ảnh hưởng trực tiếp đến hiệu quả của enzym.
Tốc độ phản ứng do enzym xúc tác phụ thuộc vào nồng độ của enzym và cơ chất. Tốc độ của phản ứng tăng khi nồng độ của một trong hai chất được tăng lên. Tốc độ gia tăng phát triển cho đến khi vị trí hoạt động được bão hòa với cơ chất. Nếu nồng độ cơ chất cao và nhiệt độ và pH được giữ ở mức phù hợp, tốc độ phản ứng tỷ lệ thuận với nồng độ enzym.Các hóa chất được gọi là chất ức chế có thể làm giảm hoặc thậm chí ngừng hoạt động xúc tác của enzym. Các chất ức chế hướng vào vị trí hoạt động chiếm vị trí hoạt động và cạnh tranh với chất nền cho vị trí hoạt động. Các chất ức chế khác, được gọi là chất ức chế hướng vào vị trí không hoạt động, gắn vào cấu trúc enzyme và làm biến dạng hình dạng của nó.
