Sự phân hủy chất thải thực vật và động vật giải phóng chất dinh dưỡng và khoáng chất vào đất, đồng thời vi sinh vật hỗ trợ quá trình phân hủy. Kết cấu và cấu trúc ảnh hưởng đến khả năng giữ lại chất dinh dưỡng, khoáng chất và các thành phần khác cần thiết cho độ phì của đất. Đất mùn cát, sự kết hợp của cát, phù sa và đất sét, mang lại sự cân bằng tốt nhất về khả năng thoát nước và duy trì chất dinh dưỡng cho hầu hết các khu vườn. Ngoài ra, cấu trúc đất quyết định tỷ lệ thoát nước, độ thoáng khí và mức độ dễ dàng mà rễ cây di chuyển trong đất. Người làm vườn thích đất dễ đóng vụn. Loại bỏ các thành phần hỗ trợ độ phì và không thể thay thế chúng, thường là ảnh hưởng của việc canh tác cường độ cao và quản lý đất kém, dẫn đến suy kiệt đất và chất lượng đất kém. Ngược lại, sự cạn kiệt khiến năng suất cây trồng kém.
Trong đất vườn, các vật liệu hữu cơ, chẳng hạn như phân trộn, phân động vật và phân xanh, tăng cường sức khỏe của đất bằng cách sản xuất chất dinh dưỡng cho cây trồng, nuôi côn trùng và vi sinh vật, đồng thời cải thiện cấu trúc đất. Phân hữu cơ bao gồm các nguồn thực vật, khoáng chất hoặc động vật giúp cải thiện độ phì nhiêu của đất mà không làm thay đổi thành phần của đất hoặc tạo ra các chất ô nhiễm.
