Tôn giáo thịnh hành của các Thuộc địa New England là Cơ đốc giáo, nhưng theo các đường lối khác biệt rõ rệt với Nhà thờ Anh giáo (hoặc Nhà thờ Anh) mà những người định cư đã chạy trốn. Cách tiếp cận của người Thanh giáo đối với Cơ đốc giáo là xa cách thực hành của họ từ Công giáo, một nhiệm vụ mà họ coi là Anh giáo đã thất bại. Cụ thể, họ bác bỏ cấu trúc giám mục (cấp bậc) của Giáo hội Anh giáo, với thứ hạng gồm các cha sở, giám mục và tổng giám mục, và thay vào đó, họ tìm cách thực hiện một cơ cấu giáo đoàn, theo đó mỗi nhà thờ, hoặc giáo đoàn, ít nhiều sẽ độc lập và tự quản. .
Cơ cấu theo chủ nghĩa hội thánh này cho phép các nhà thờ tự thu xếp thuế và thuê, cũng như sa thải, các thừa tác viên của chính họ. Họ cũng rất chọn lọc thành viên của mình, mặc dù thực tế là việc tham dự nhà thờ là bắt buộc. Các tiêu chuẩn cao của Nhà thờ Thanh giáo khiến sự tồn tại của nó qua nhiều thế hệ trở nên khó khăn, và các nhà lãnh đạo nhà thờ buộc phải làm dịu các yêu cầu của họ với "Giao ước Half-Way" vào năm 1662. Điều này cho phép những trẻ em đã được rửa tội từ chối làm chứng được cấp quyền thành viên một phần. , nhưng không phải là thánh, điều này sẽ cho phép họ bỏ phiếu về các công việc của nhà thờ và rước lễ.
Những người Thanh giáo duy tâm về mặt tôn giáo còn được gọi là Những người theo chủ nghĩa Không tách biệt để phân biệt họ với nhóm những người theo chủ nghĩa cải cách nhà thờ cực đoan hơn, mặc dù nhỏ hơn nhiều, được gọi là Những người theo chủ nghĩa tách biệt. Nhóm này, có lẽ thường được gọi là Những người hành hương của Thuộc địa Plymouth, đã đến trước những người Thanh giáo, tìm cách phá vỡ các truyền thống của Giáo hội Anh giáo.
