Phản ứng với ánh sáng ở thực vật là một chuỗi phức tạp của các yếu tố kích hoạt và vòng phản hồi sử dụng một số protein trong tế bào để chuẩn bị và xử lý ánh sáng, dẫn đến sự phát triển, ra hoa và hướng về ánh sáng. Các protein chịu trách nhiệm cho phản ứng ánh sáng là FHY3, FAR1, FHY1, FHL và phytochrome A.
Thực vật bắt đầu phản ứng với điều kiện thiếu ánh sáng bằng cách tạo ra cặp protein được gọi là FHY3 và FAR1. Hai protein này làm tăng sản xuất một cặp protein khác được gọi là FHY1 và FHL. Thực vật dự trữ các protein này để nó có thể phản ứng với ánh sáng ngay khi có. Một loại protein được gọi là phytochrome A phát hiện ánh sáng ở đầu xa màu đỏ của quang phổ, bắt đầu phản ứng ánh sáng của thực vật trước khi con người có thể nhìn thấy nó.
Khi phytochrome A được kích hoạt, nó liên kết với FHY1 và FHL, dẫn đến sự tích tụ phytochrome A trong nhân tế bào. Phytochrome A điều chỉnh hoạt động của các gen trong nhân tế bào chịu trách nhiệm cho sự phát triển của cây. Khi hoạt động của gen thay đổi, thực vật sẽ phản ứng với sự phát triển, ra hoa hoặc căng thẳng về phía ánh sáng. Khi càng nhiều phytochrome A tích tụ trong hạt nhân, thì sẽ tạo ra ít FHY3 và FAR1 hơn, tạo ra một vòng phản hồi tiêu cực hạn chế phản ứng ánh sáng của cây.
