Theo Discovery, có nhiều giả thuyết về lý do tại sao loài voi ma mút lông cừu bị tuyệt chủng, từ bệnh tật và nạn săn bắn cho đến một loại thảm họa tự nhiên nào đó. Tuy nhiên, bằng chứng cho thấy biến đổi khí hậu có thể gây ra là thủ phạm thực sự.
Voi ma mút lông cừu chủ yếu tuyệt chủng vào cuối kỷ băng hà cuối cùng, khoảng 10.000 năm trước. Tuy nhiên, một quần thể voi ma mút lông cừu đã sống sót ở Alaska cho đến năm 3750 trước Công nguyên. Cũng có một dân số ở một vị trí xa xôi trên một hòn đảo ở Bắc Băng Dương tồn tại cho đến năm 1700 trước Công nguyên. Lý do chính xác khiến họ chết là một bí ẩn, mặc dù bệnh tật chỉ là một giả thuyết. Khác là tổ tiên của loài người đã săn bắt chúng đến mức tuyệt chủng. Sau đó, có giả thuyết cho rằng một cơn bão lớn đã quét sạch quần thể voi ma mút lông cừu chỉ trong một lần rơi xuống.
Một giả thuyết khác về sự tuyệt chủng đang có cơ sở là biến đổi khí hậu cuối cùng đã khiến voi ma mút lông cừu chết dần. Những loài động vật này đặc biệt thích nghi với cái lạnh trong thời kỳ băng hà cuối cùng, với lớp da dày, xù xì, lớp lông cừu và bướu có chất béo tích tụ. Tuy nhiên, sự ấm lên đã làm suy giảm dân số. Bên cạnh bộ lông dày, voi ma mút lông cừu còn được biết đến với kích thước lớn và chiếc ngà dài và cong.