Những kẻ thù của Socrates buộc tội ông ta vô đạo đức vì họ coi ông ta như một trách nhiệm chính trị; triết lý của ông mâu thuẫn với nền tảng của nền dân chủ Athen, và hai trong số các môn đệ của ông là những kẻ chủ mưu chính của các cuộc nổi dậy chống lại nền dân chủ vào năm 411 và 404 trước Công nguyên Nhiều người đàn ông nổi tiếng của thành phố đã ghét bỏ Socrates vì cách trò chuyện biện chứng của ông đã khiến họ sự bối rối của công chúng. Socrates cũng giữ quan điểm tôn giáo không chính thống vào thời điểm đó.
Một phần của cáo buộc chống lại Socrates là do ông bị cho là không tin vào các vị thần của Athens. Trái ngược với những gì nhiều người gièm pha ông khẳng định, Socrates không phải là một người vô thần. Nhưng ông không tin vào quan điểm truyền thống của các đền thờ Hy Lạp. Socrates tin rằng chỉ có một vị thần duy nhất, và ông không tin vào một vị thần thiếu sót, đáng chê trách như những gì được miêu tả trong thần thoại Hy Lạp.
Bất chấp những tuyên bố là bất chính, bản cáo trạng của Socrates có động cơ chính trị. Socrates không tin vào dân chủ. Ông tin rằng những người khôn ngoan nên cai quản, và ông không nghĩ rằng dân chúng nói chung có đủ đức hạnh hay sự khôn ngoan.
Socrates cảm thấy rằng chính nền dân chủ đã dẫn đến sự sụp đổ của Athens trong Chiến tranh Peloponnesian. Ông xem Sparta là có một hình thức chính phủ mẫu mực hơn. Hai trong số các đệ tử của Socrates, Alibiades và Critias, đã dẫn đầu các cuộc nổi dậy chống lại nền dân chủ Athen. Các nhà lãnh đạo dân chủ của Athens coi Socrates là nguyên nhân gây ra bất ổn chính trị.