Mặc dù máy tính thường được ca ngợi là một công cụ hữu ích trong lớp học, chúng cũng bị chỉ trích. Những lời phàn nàn đáng chú ý bao gồm việc chúng tạo ra sự phân tâm nếu việc sử dụng của học sinh không được giám sát tốt, rằng chúng có thể dẫn đến việc thiếu các kỹ năng cơ bản nếu dựa vào sự hướng dẫn và rằng chúng có thể rất tốn kém để cung cấp và duy trì.
Quản lý việc sử dụng của học sinh là điều cần thiết để sử dụng hiệu quả máy tính trong lớp học. Việc sử dụng cá nhân trong quá trình giảng dạy có thể tạo ra sự xao nhãng trong các bài học. Điều quan trọng là phải cung cấp định dạng sử dụng rõ ràng để học sinh giải thích khi nào và cách sử dụng chúng, bao gồm cả việc mất quyền sử dụng nếu họ không tuân thủ.
Ngoài ra, học sinh có thể không học được một số kiến thức cơ bản nếu họ phụ thuộc quá nhiều vào máy tính để được hướng dẫn, đặc biệt là về viết và toán. Sử dụng chương trình xử lý văn bản của máy tính để chỉnh sửa tác phẩm của mình, họ có thể không học được các quy ước viết chuẩn. Việc phụ thuộc vào máy tính hoặc máy tính tiên tiến để dạy toán có thể làm giảm hiểu biết của học sinh về những kiến thức cơ bản cần thiết của các khái niệm toán học.
Ngoài ra, việc cung cấp và bảo trì máy tính có thể rất tốn kém. Nhiều trường có thể gặp khó khăn hoặc không thể cung cấp nguồn tài liệu này cho học sinh. Nếu chỉ có số lượng máy tính hạn chế, học sinh có thể phải chia sẻ chúng giữa các nhóm nhỏ, điều này có thể làm mất đi những lợi ích tiềm năng của việc học máy tính.
