Việc sử dụng máy tính trong lĩnh vực vi sinh bao gồm việc sử dụng trong kiểm tra, phân tích và báo cáo trong phòng thí nghiệm, tích lũy và lưu trữ dữ liệu cũng như tiến hành nghiên cứu và thử nghiệm. Máy tính cũng đóng một vai trò quan trọng trong việc chia sẻ thông tin, xác định các bệnh mới và dịch bệnh, phát triển các phương pháp điều trị mới cho các bệnh và nhiễm trùng cũng như dự báo các xu hướng.
Các báo cáo có niên đại từ năm 1971 ghi lại việc sử dụng máy tính để chuẩn bị báo cáo kết quả xét nghiệm bệnh nhân. Đến năm 1984, các nhà khoa học nhận ra tiềm năng của việc xen kẽ các máy vi tính thực hiện công việc trong phòng thí nghiệm với các máy lớn hơn để tạo thành mạng thông tin giữa bệnh viện và phòng thí nghiệm.
Máy tính tiếp tục thực hiện các chức năng này và các chức năng bổ sung, đồng thời đóng vai trò lớn hơn trong việc tập hợp và phân tích dữ liệu cũng như phổ biến kết quả. Các nhà nghiên cứu sử dụng máy tính để giúp phát triển và duy trì các kiểm soát thử nghiệm, chẳng hạn như điều kiện môi trường, trong quá trình thử nghiệm. Máy tính giúp các nhà nghiên cứu đánh giá tính nhạy cảm hoặc khả năng kháng thuốc của các chủng khác nhau.
Máy tính cũng hỗ trợ các nhà nghiên cứu trong việc xác định và phân tích các chủng sinh vật mới cũng như phát triển các loại thuốc mới để điều trị chúng. Các ứng dụng khác bao gồm việc phát triển các mô hình máy tính để dự báo sự lây lan của dịch bệnh và dự đoán các đợt bùng phát và dịch bệnh.