Mặc dù rất hiếm nhưng cá mập đã được biết là tấn công và giết cá heo, trong khi cũng có bằng chứng về việc cá voi sát thủ ăn thịt cá heo, theo National Aquarium, một trang web do Bio Expedition điều hành. Vì cá heo là trên đầu chuỗi thức ăn, rất ít động vật được coi là kẻ thù của chúng.
National Aquarium, cho biết thêm rằng con người là mối đe dọa lớn nhất đối với cuộc sống của cá heo. Ở Nhật Bản, cá heo được coi là một món ăn ngon và bị săn bắt vì mục đích ẩm thực, trong khi một số ngư dân giết cá heo vì chúng làm mồi cho những con cá nhỏ hơn và làm hỏng việc đánh bắt của chúng. Tuy nhiên, số lượng cá heo chết nhiều nhất là do tai nạn trong quá trình đánh bắt cá ngừ quy mô lớn. Đánh bắt cá ngừ được coi là đặc biệt nguy hiểm đối với cá heo vì những đàn cá ngừ lớn bơi bên dưới cá heo. Mặc dù những con cá heo sống sót thường được thả trở lại đại dương, Dolphin's World ước tính rằng các cuộc thám hiểm đánh bắt lớn đã giết chết ít nhất 30 triệu con cá heo kể từ năm 1960.
