John Adams và vợ Abigail có sáu người con. Con gái lớn nhất của ông, Abigail, sinh năm 1765 và tổng thống tương lai John Quincy Adams sinh năm 1767. Con gái thứ hai, Susanna, được sinh ra năm 1768, tiếp theo là Charles năm 1770, Thomas Boylston năm 1772 và Elizabeth năm 1777.
John Adams sống lâu hơn nhiều con riêng của mình và chỉ có John Quincy là có cuộc sống sung túc. Abigail qua đời vì bệnh ung thư vú vào năm 1813, Susanna qua đời chỉ sau một năm sống, còn Elizabeth thì chết trong bụng mẹ. Adams trở nên ghẻ lạnh với con trai mình là Charles vào năm 1798, và Charles sẽ chết ở thành phố New York hai năm sau đó. Con trai ông, Thomas Boylston, nghiện rượu trong những năm cuối đời và qua đời vào năm 1832.