Theo Nature Education, các enzym giới hạn được sử dụng để cắt ADN thành các đoạn nhỏ hơn, sau đó có thể được phân tách theo kích thước thông qua điện di trên gel. Các enzym giới hạn điển hình sẽ cắt ADN tại bốn hoặc sáu vị trí nhận dạng cặp bazơ, dẫn đến các đoạn DNA rất nhỏ.
Theo trang web Công nghệ Sinh học của Bang Colorado, các enzym giới hạn có nguồn gốc từ các enzym của vi khuẩn, một dạng hệ thống miễn dịch thô sơ đối với vi khuẩn. Các enzyme này phát triển để cắt và phá hủy bất kỳ DNA lạ nào trong vi khuẩn, đó là lý do tại sao chúng cắt DNA thành những mảnh nhỏ. Enzyme hạn chế và điện di trên gel cũng được sử dụng cho công nghệ tái tổ hợp DNA, cho phép hoán đổi các gen đã được thiết kế để hoán đổi vị trí trong và ngoài DNA cho mục đích nhân bản.
