Nhiều loại động vật gọi sông Amazon là quê hương là cá heo sông Amazon, rái cá biển khổng lồ, cá piranha, lợn biển Amazon, rùa sông Amazon khổng lồ và cá chình điện, trong số nhiều loài khác. Sông Amazon là nơi sinh sống của hơn 2.500 loài cá, cùng với nhiều loài động vật có vú, lưỡng cư, rắn và thực vật khác. Sông Amazon được xếp vào loại sông dài nhất thế giới và tự hào về sự đa dạng sinh học lớn nhất trong tất cả các con sông trên toàn cầu.
Sông Amazon chứa một số loài nổi tiếng, chẳng hạn như cá heo, cùng với các sinh vật ít được biết đến hơn và những loài đang chờ phân loại. Một số sinh vật Amazon được phân loại là có nguy cơ tuyệt chủng hoặc dễ bị tổn thương, chẳng hạn như cá heo sông Amazon. Loài cá heo này, còn được gọi là cá heo hồng, chỉ sống được trong môi trường sống nước ngọt. Cá heo hồng sống ở các phụ lưu và cửa sông của nhiều quốc gia Amazon, bao gồm Ecuador, Brazil và Peru. Rái cá sông khổng lồ, một loài có nguy cơ tuyệt chủng, sống dựa vào chế độ ăn uống là cá. Những con rái cá này cao tới 6 feet khi trưởng thành và nặng hơn 200 pound. Chúng phải đối mặt với các mối đe dọa từ một số nguồn, bao gồm buôn bán lông thú và mất môi trường sống. Cá Piranha, một trong những loài cá hung dữ nhất, có vẻ ngoài khác biệt nhờ đôi mắt đỏ rực và hàm răng dài sắc nhọn. Chỉ có một số loài cá này gây ra mối đe dọa cho con người. Chúng đóng vai trò quan trọng trong hệ sinh thái Amazonian, ăn xác động vật và thực vật chết và thối rữa.