Đại bàng hói có thể đẻ tới năm quả trứng, mặc dù các ổ đẻ từ một đến ba quả trứng phổ biến hơn nhiều; Những quả trứng này thường nở thành công hỗn hợp, với đại bàng trung bình kết thúc với một lứa con gồm khoảng hai con. Tuy nhiên, ở một số địa điểm, tỷ lệ nở thành công cao đã được báo cáo, dẫn đến việc bố mẹ có ba hoặc bốn con đại bàng hói. . Các cặp đại bàng hói làm tổ có xu hướng canh chừng trứng của chúng mọi lúc do nguy cơ bị những kẻ săn mồi trong tổ như sóc và các loài chim săn mồi bao gồm cả quạ và mòng biển xâm nhập.
Trứng đại bàng hói tương đối lớn đối với trứng chim và có kích thước tương đương với quả bóng chày. Những quả trứng này đủ cứng cáp để chịu được trọng lượng của một con đại bàng hói trưởng thành và chúng thường có màu hơi trắng hoặc trắng nhạt. Những con trưởng thành phải ngồi trên những quả trứng không chỉ để xua đuổi những kẻ săn mồi mà còn để giữ cho những quả trứng đủ ấm để có thể sống được. Trong một số trường hợp, các hiện tượng thời tiết khiến điều này không thể thực hiện được, và ngay cả những bậc cha mẹ đại bàng hói siêng năng nhất cũng có thể kết thúc với những quả trứng không thể sống được sau một tích tắc lạnh giá. Những quả trứng được ấp hơn một tháng trước khi nở, và cả đại bàng đực và đại bàng cái đều chia sẻ trách nhiệm giữ cho những quả trứng được an toàn và ấm áp.
