Số proton mà một nguyên tử có phụ thuộc vào nguyên tố đó là gì. Ví dụ, một nguyên tử hydro chỉ có một proton. Một nguyên tử nitơ có 7 proton, một nguyên tử antimon có 51 proton và một nguyên tử radium có 88 proton.
Các proton cũng xác định số nguyên tử. Do đó, hydro có số nguyên tử là 1, trong khi nitơ có số nguyên tử là 7.
Các proton được tìm thấy trong hạt nhân của nguyên tử. Chúng có một điện tích dương. Thông thường, có cùng số electron trong nguyên tử với số proton. Vì các electron mang điện tích âm nên một nguyên tử bình thường không có điện tích.