Có ba liên kết giữa các phân tử cytosine và guanine, như đã thấy trên Cổng thông tin Giáo dục. Cytosine và guanine đều là các phân tử nucleotide. Hai nucleotide này tạo thành một liên kết hydro mạnh được tìm thấy trong cả axit deoxyribonucleic (DNA) và axit ribonucleic (RNA).
Cao đẳng cộng đồng Clackamas giải thích rằng hai loại liên kết hydro tồn tại giữa các sợi DNA: liên kết adenine với thymine (A-T) và liên kết cytosine với guanine (C-G). RNA khác với DNA vì RNA sử dụng phân tử uracil thay vì thymine (A-U). Adenine kết nối với thymine bằng hai liên kết hydro trong DNA và adenine kết nối với uracil bằng hai liên kết trong RNA.
Ba liên kết hydro tạo ra một liên kết mạnh hơn hai liên kết hydro vì số lượng liên kết hydro ảnh hưởng trực tiếp đến độ bền của liên kết. Điều này làm cho liên kết cytosine-guanine mạnh hơn liên kết adenine-thymine trong DNA (và liên kết adenine-uracil trong RNA) vì liên kết cytosine-guanine có thêm một liên kết hydro.
Cả ba liên kết giữa cytosine và guanin đều chứa hydro trên cytosine hoặc phân tử guanin. Cytosine kết nối một trong những nguyên tử hydro của nó với một phân tử oxy trên guanin tạo thành một kết nối. Liên kết tiếp theo nối nguyên tử nitơ với nguyên tử hydro trên phân tử guanin. Liên kết thứ ba nối nguyên tử oxy với một nguyên tử hydro khác trên phân tử guanin.
